Bonjour,
Un clapet ne servirait à rien et aurait même tendance, à terme, à rendre moins efficace l'évacuation des eaux chargées. Idem pour un grillage où viendraient se bloquer les détritus.
J'ignore comment est fait ton logement mais le risque qu'un rat ne remonte par le WC est marginal.
Certes il est bon nageur mais en principe, ta canalisation d'évacuation du WC est "vide" (puisque l'eau s'évacue), de sorte qu'il ne peut pas remonter à la nage. De même, ta canalisation est nécessairement verticale à un endroit et, sauf à ce que la hauteur soit très faible, le rat aura des difficultés à y grimper puisque les tuyaux PVC sont extrêmement glissants. Enfin, à supposer que le rat soit motivé et arrive à ta cuvette, il ne pourra pas en sortir car il lui sera impossible de grimper sur la céramique ou de sauter de la cuvette (pas d'appui). Il fera donc vraisemblablement demi tour. Enfin, pour te rassurer et même si cela n'est pas utile, il te suffira de laisser l’ablatant fermé pour être certaine qu'il n'arrive pas à l'intérieur de la maison.
Quant au pourquoi ce rat était présent, je pense que ton plombier a fait sauté un bouchon et que les habitants souterrains ont ainsi eu accès à une zone qui leur était auparavant bloquée et qu'ils ont souhaité visiter. Le fait qu'ils utilisent ce conduit pour se déplacer ne signifie pas qu'ils vont sortir chez toi, sauf à ce que quelque chose ne vienne les attirer. Sur ce point, évites d'ailleurs les raticides car même s'ils tuent les rats, ils risquent d'abord d'attirer la colonie. Peut-être existe-t-il des répulsifs qui pourraient être utiles si vraiment tu as peur, mais je pense que cela serait inutile.
Dernière précision : tu n'ignores pas que les rats habitent les grandes villes et que, hormis dans des "taudis", il est plus que rare de les voir s'installer dans un logement car ils ont peur de l'homme. A la différence des souris ou mulots ou autres petits rongeurs prêts à entrer chez toi pour grignoter tes provisions, le rat ne se risquera donc pas à entrer s'il sent de la présence au foyer.
En conclusion, sois sereine et dors sur tes deux oreilles : il ne va pas venir t'embêter de si tôt !